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背鳍基室数290(222-360)，腹鳍基室数58(35-91)，肌节总数65(61-69)，包括鳃孔前38(34-43)＋鳃孔至肛门孔16.8(14-21)＋肛门孔后10.4(8-12)，生殖腺数最多可达25，背鳍基室长宽比约为2.5～3.5，鳃孔后及鳃孔前长度比为0.42～0.54，肛门位于腹侧尾鳍中央靠前处，此种文昌鱼成熟体型最长可达7cm。
厦门文昌鱼主要分布于东亚海域，如日本南端、中国沿海、东印度群岛、菲律宾、西印度洋、新加坡、泰国、香港及东南非等。本省于金门常见，本岛则于北部偶有发现。
底栖于含沙之环境中，喜大量粗砂加少量细砂的底质，平常半埋砂中，仅露出前端于水层中滤食浮游生物维生。
在文昌鱼的所有种类中，只有位于大陆地区的厦门文昌鱼被人们所食用而有商业价值，在同安地区的鱼场已有三百多年的历史，然而近年来由于环境破坏及过度捕捞已造成大量减产，目前中国大陆方面已将其列入国家重点保护动物，并于1991年划设文昌鱼自然保护区（二级）。